海空联运操作系统共分为：系统功能、代码维护、海运出口、海空联运、海运进口、财务管理、统计查询、数据管理等八大模块。
系统功能模块：包括用户权限设置，打印机设置等；管理员可根据组来进行控制。分用户组来进行管理，以保证数据的保密性。
代码维护模块：日常资料维护，一次维护即可，避免在以后的业务中重复输入信息，方便快捷。
海运出口模块：海运出口业务的操作模块，根据业务流程，在此模块中输入、查询、打印相关的业务信息。